Il mammut svela il suo antico proteoma

[frankyone]

Grazie al perfezionamento di tecniche di spettroscopia di massa, un gruppo di ricercatori è riuscito a identificare ben 126 sequenze proteiche da un femore di mammut lanoso aprendo così le porte alla possibilità di utilizzare la paleoproteomica come mezzo per definire relazioni filogenetiche fra le specie di Jo Marchant



Un gruppo internazionale di scienziati è riuscito a identificare 126 distinte sequenze proteiche da un osso di mammut lanoso (Mammuthus primigenius) risalente a 43.000 anni fa. Lo studio, pubblicato sul "Journal of Proteome Research", dà impulso al campo della paleo-proteomica grazie all'identificazione di sequenze proteiche preistoriche che potrebbero essere utilizzate per identificare specie, relazioni evolutive e anche, forse, antiche malattie. L'analisi proteomica potrebbe quindi essere utilizzata come alternativa all'analisi del DNA nei campioni troppo degradati per contenere materiale genetico utile.

In precedenza erano state pubblicate sequenze proteiche di fossili di dinosauro, tra cui diverse di un Tyrannosaurus rex di 68 milioni di anni e di un adrosauro di 80 milioni di anni fa, ma i risultati si erano rivelati controversi.

Questi e altri studi di antiche proteine avevano identificato "una o alcune" delle proteine più abbondanti nelle ossa, come il collagene, osserva Enrico Cappellini, In forza presso il Centro di geogenetica del Natural History Museum of Denmark, a Copenaghen, e autore principale dello studio.

Ritenendo che fosse possibile fare di meglio, Cappellini si è così messo al lavoro con alcuni ricercatori del Novo Nordisk Foundation Center for Protein Research, con sede a Copenaghen, e utilizzando le più avanzate tecniche di spettrometria di massa, ha studiato campioni di un femore di mammut trovato nel 1993 nel permafrost della Jacuzia.

Cappellini dice che il suo gruppo ha perfezionato ogni singola fase fase della tecnica - tarandola grazie a campioni moderni che presentano molto materiale di alta qualità - così da massimizzare la sensibilità alle tracce di proteine, e sviluppando severi controlli per eliminare le contaminazioni. I ricercatori hanno scoperto, per esempio, di dover rinunciare all'uso di guanti in lattice dopo aver riscontrato la presenza di peptidi provenienti dall'albero della gomma (Hevea brasiliensis).



Precedenti analisi del DNA dello stesso mammut avevano rivelato che l'animale probabilmente aveva una pelliccia di colore scuro. Cappellini dice di non poter fare rivelazioni simili: "Abbiamo cercato disperatamente di informazioni relative alla biologia dei mammut", dice, ma senza successo.

Ma anche così, osserva Mary Schweitzer, paleontologa alla North Carolina State University a Raleigh, e membro dell'équipe che aveva studiato le proteine di dinosauro, lo studio "è esaltante" perché si tratta della prima ricostruzione di un così gran numero di antiche proteine: "Questo studio ci fa sperare in un rigoroso controllo molecolare delle ipotesi filogenetiche attraverso biomolecole diverse dal DNA".

Proteine promettenti
Oltre al collagene, il team ha identificato una serie di proteine coinvolte nella matrice extracellulare del tessuto osseo e alcune proteine del sangue, tra cui l'albumina. I ricercatori sono particolarmente entusiasti per albumina perché, a differenza del collagene, la sua sequenza di aminoacidi varia notevolmente da una specie all'altra, e la sua sequenza potrebbe quindi essere utile per identificare le specie e studiare le relazioni filogenetiche.

Come ci si aspettava, le sequenze proteiche del mammut sono strettamente collegate a quelle degli elefanti moderni, ma i ricercatori hanno messo in evidenza alcune differenze: in due punti l'albumina di mammuth, per esempio, possedeva amminoacidi diversi da quelli degli elefanti africani e asiatici odierni (rispettivamente Loxodonta africana ed Elephas maximus).

Le sequenze di proteine non forniscono altrettante informazioni del DNA, ma sono più stabili, per cui i ricercatori sperano di poter ottenere informazioni anche da antichi campioni in cui il DNA è degradato. La proteomica di un antico animale potrebbe quindi fornire informazioni sulla funzione delle proteine che non sono contenute nel suo DNA, ma potrebbe anche essere sfruttata, almeno in teoria, per cercare indizi di mutazioni che potrebbero essere segno della presenza di antiche malattie

Ma, prima, Cappellini vuole studiare come le proteine sopravvivano nelle diverse condizioni e i meccanismi attraverso cui si degradano. Con il suo gruppo è stato in grado di identificare anche 35 proteine da un mammut rinvenuto nel sito di Dent, in Colorado, e 19 da un mammut scoperto nel sito de La Sena. in Nebraska; Dato che entrambi questi esemplari sono stati scoperti in località degli Stati Uniti caratterizzate da un clima molto più caldo, ciò dimostra che la tecnica può essere applicata anche a campioni antichi che non si siano conservati grazie al congelamento.

"Ora possiamo tornare indietro nel tempo e vedere che cosa siamo in grado di rilevare nei vecchi campioni", dice Cappellini. IL prossimo passo sarà lo studio di resti risalenti a centinaia di migliaia di anni fa.

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